Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder cookies. Jag förstår

En smartare it-nyhetssajt

Spel-AI för celler

En AI-baserad teknik för att analysera sociala nätverk har fått betydelse för individanpassad vård och framtidens läkemedel. Det är forskare vid Uppsala universitet som sett möjligheterna med den avancerade bildanalystekniken för att hantera viktig information som andra metoder missar.

Text anne hammarskjöld Foto adobestock 2 november 2020 digit

Stamceller I 3D

– Vi utnyttjar de senaste metoderna inom AI, eller mer specifikt grafbaserade neurala nätverk som utvecklats för att analysera sociala nätverk och anpassar dem för att förstå biologiska mönster och gradvisa variationer i vävnadsprover, säger Carolina Wählby, professor vid institutionen för informationsteknologi vid Uppsala universitet.

– Man kan likna cellerna vid sociala enheter som liksom grupper av individer kan definieras utifrån de aktiviteter de delar inom sina sociala nätverk som till exempel Twitter, sökningar på Google eller val av tv-serier.

Kort om celler

Vävnaden som bygger upp våra organ består av biljoner celler med olika funktion. Alla celler hos en individ har samma gener, DNA, som finns i cellkärnan.

Generna uttrycks genom att molekyler kallade budbärar-RNA med information om vad som ska göras skickas ut från cellkärnan till resten av cellen. Kombinationen av mRNA definierar på så sätt cellens arbetsuppgifter i kroppen.

RNA kan avläsas med hjälp så kallad in situ-sekvensering, där miljontals avlästa mRNA syns som prickar i en mikroskopibild av vävnaden. Det är en svår utmaning att urskilja alla viktiga detaljer.

Källa: Uppsala universitet

Algoritmer ser mer

Forskare vid Uppsala universitet har utvecklat en ny bildanalysmetod för att lära mer om kroppens celler och vävnad. Den avancerade tekniken är baserad på AI-algoritmer som från början togs fram för att förstå sociala nätverk. Metoden kan läsa av enorma mängder information om såväl funktioner inom en enskild cell och interaktioner mellan celler.

Tidigare analysmetoder är beroende av att det redan är känt vilka celltyper som finns i vävnaden och att cellkärnorna i den är identifierade. Det kan också vara svårt att hitta de olika cellkärnorna om till exempel cellerna ligger tätt.

– Med vår analys som vi kallar spage2vec kan vi nu få fram motsvarande resultat utan någon förkunskap om förväntade celltyper och kan dessutom hitta nya celltyper och funktioner inom eller mellan celler i vävnaden, säger Carolina Wählby.

Hjärtats utveckling

Forskargruppen arbetar nu vidare med sin analysmetod genom att undersöka hur olika celltyper uppstår och organiserar sig under hjärtats tidiga utveckling. Det är ren grundforskning som syftar till att öka kunskapen om dessa mekanismer, både när allt fungerar som det ska och vid sjukdom.

Det finns också förhoppningar om att kunna använda analysmetoden för att bättre förstå cancer. Målet är att det på sikt ska kunna leda till bättre behandlingar som anpassas efter varje patient.

Källa: Uppsala universitet

Senaste nytt

Nätfiske med paket

15 januari 2021

Microsoft och DHL är de varumärken som används mest vid phishingförsök. De mest utnyttjade branscherna är teknik, följt av logistik och detaljhandel. 

Kommuner ikapp 2035

14 januari 2021

Behovet av digital kompetens har fördubblats de senaste 15 åren inom offentlig sektor. Först 2035 spås myndigheter, regioner och kommuner att vara ikapp den privata sektorn.

Lämnar VMware för Intel

14 januari 2021

Pat Gelsinger ersätter Bob Swan och blir ny vd på Intel. Pat Gelsinger kommer närmast från rollen som vd för VMware men har en lång historia med Intel, där han började jobba som tonåring.

Hundens nya vän

14 januari 2021

En uppkopplad dörr låter din hund springa in och ut ur huset som den vill, utan att du behöver vara hemma. 

Svensk sand i 3D

13 januari 2021

Idag används sand från Tyskland i 3D-skrivare, trots att svensk sand skulle innebära en bättre kvalitet till en lägre kostnad och ökad hållbarhet. Det konstaterar ett forskningsprojekt vid Rise.

Toan kollar din hälsa

13 januari 2021

Det japanska företaget Toto har tagit fram en Wellness Toilet som kontrollerar användarens avföring och analyserar personens hälsa, varje gång toaletten används.